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李相辰/甲基化生信分析pipeline

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manhattan.r 328 Bytes
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Vincent.Gao 提交于 2022-01-26 17:37 . 更新文件
library("qqman") #引入所需的qqman package
Args <- commandArgs()
result_file<- Args[6] #获取输入文件名字信息
result_file1<- Args[7] #获取输出文件名字信息
a <- read.table(file=result_file,header=T)
png(result_file1)
manhattan(a,highlight = snpsOfInterest,col=c("#A4D3EE","#DDA0DD"))
dev.off()
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